通所介護の加算算定 保健所監査について

今月から通所介護、通所リハの施設で管理栄養士をしているものです。
来月あたりから栄養改善加算を取りたいとの話を施設責任者からされまして、準備を進めていく所なのですが、算定の申請をした時に保健所の監査のようなものは来るのでしょうか？
今まで調理員しか置いていなかったようで厨房設備が全然整っておらず、大量調理マニュアルに沿うと全然基準を満たしておりません。責任者に尋ねたところ、保健所は通さないから今のままで申請すると言われましたが、基準を満たしていないところで加算の申請が通る気がしません。このまま申請されてしまうと準備が間に合わないので確認してからまた責任者に話をしようと思っていますが、なかなか新規の算定で保健所監査があるという文面が見つからず困っています。分かる方教えていただきたいです。