保存食の採取について

こんにちは
４月から、新規の民間保育園で、栄養士として勤務しています。
保育園勤務は初めてです。

保存食の採取についてお聞きしたいことがあります。

原材料と調理済み食品をそれぞれ50gずつビニール袋にいれて、それぞれ採取したのち、それを同じビニール袋にまとめて入れています。

原材料の袋と、調理済み食品の袋は別々にした方がいいでしょうか？

また、午前と午後のおやつの牛乳も採取しますか？

それから、例えばアレルギー食で「ハム抜きの和え物」などがあった場合は、それも採取しますか？

すみませんが、よろしくお願い致します。