原材料の保存食の取り方について

原材料の保存食を取る時に、オレンジなら身の部分だけではなく、身と皮を半分ずつなどで50gというのは大丈夫でしょうか？
青ネギなどであれば、1本そのままを取り後は破棄する根の部分を入れたりするのはありですか？
可食部だけではないといけないのでしょうか。
施設によって色々あるみたいなのでどうすれば良いか悩んでいます。