実務経験とお給料について

初めて投稿させていただきます。
いつもここのQ&Aや相談を拝見させていただき、いろいろと考えさせていただいています。ありがとうございます。

私は大学卒業後委託会社に就職し、病院で勤務していました。（1年3ヶ月）
シフトや通勤の関係上実家通いが困難だったので1人暮らしをしていましたが、幸運なことに、たまたま地元近くの病院から内定をいただき、転職することにしました。
しかし、転職後、急に家族が体調を崩して看護をしなければいけなくなってしまい、看護休暇を取りたかったのですが、いつ復職できるかその時点ではまだ検討がついていなかったことと、「未経験で直営に入ってまだまだ新米で教わる身なのにそんなことを言うなんて生意気だ」というような事を言われ、休暇を取るなら他の人に来てもらいたいから退職してほしいというような内容の話を栄養科のトップに言われました。
せっかく内定をいただいてこれから頑張りたいというところでこういった状況になってしまい、まさか退職を勧められるとは思いませんでした。
たしかに急性期の病院ということもあり、多忙な業務のなか私みたいな未熟者がそういったことを申し出るのはとても失礼なことのように思いますが、やはり自分の親だということ、兄弟や親戚はみな離れたところに住んでいること、現段階では近くに住む私が頑張らなければいけないということから退職を選びました。

現在は自宅療養となり、兄弟も地元に戻ることになったので、前よりは家族のフォローを得られるので、すべて私が背負いこむ必要はなくなりました。
なので、やはり私もそろそろ働きたいと思い、ハローワークや転職サイトで求人を探し面接に行ったりしています。

今日とある病院の面接に行ってきたのですが、療養型の病院なので長期入院の患者様が多く、栄養指導をばりばりやるというよりは、食形態に気を配ったり、嗜好調査、イベント食の考案、監査資料作成等の業務がメインだということでした。厨房は委託が入っているそうですが、特養と似たような印象でした。

ここで質問なのですが、面接時に提示された給与が委託会社・病院に務めていた時よりも（通勤手当以外の住宅手当等込で）約3万円近く下がることで多少不安を感じました。
昇給はほぼないのに等しいそうで、管理栄養士は2人体制だそうですが、1人が退職するため欠員補充のための募集だと聞きました。4週6休制で、平日などに代休をとったりするそうです。

これから資格を活かして働くなら直営で働きたいと考えています。
今後転職するにしても経験を積むために労働条件に多少納得がいかなくてもには目をつぶって頑張るべきでしょうか。この話を聞いて納得しました、というような同意書にサインさせられてしまい、給与面では今後交渉は難しいと思います。
経験がないのにこのように考えてしまうのは甘すぎるのはわかっています。

ただすんなり受け入れられていない自分がいます。
今後私はどういうふうに考えていけばいいでしょうか？進路の決め方等についても、どなたかアドバイスをいただけると幸いです。よろしくお願い致します。