監査書類について

納品伝票のことについて聞きたいのですが。
私の施設は特養で、入居者120、職員15ぐらいなのですが、伝票を入所と職員と分けてパソコンで発注しています。
食事は同じものを出しているのですが、伝票を分けると入力、照合に時間がかかるので、一緒だと大分楽になるんですが。
やはり、監査書類でひっかかるのでしょうか？分けないといけない理由があるのでしょうか？
回答よろしくお願い致します。