衛生管理どこまで守ればいいのでしょうか?

新しい厨房が完成しました。「新調理システム」を導入し、なれない動きに四苦八苦しながらもスタッフと知恵を出し合いながらオープンの日を迎えました。
このシステムの導入に合わせ「大量調理マニュアル」に基づいた衛生管理をしていこうと、厨房を担当した業者の指導をいただきながらいろいろなプランを考えてきました。
オープンの日が近くなり、私があまりにも多忙だったため、献立・作業工程については後輩の栄養士に任せました。ところが、後輩達は大量調理マニュアルに記載されていないルールを提案し、実際にその業務を行うことにより、調理工程に支障を来す結果になっています。
業者にもどのような指導したか確認しましたが、あくまでもこの作業をすることでより衛生的な環境で食事提供ができると提案しただけで、強制したことではないと言われました。
そのことを伝えても「綺麗な環境で食事を提供したい」と言い、考えを曲げようとしません。
皆さんの施設では、パックタイプの流動食や牛乳、米の袋などの外装を次亜水などで除菌していますか?
また、サラダなどの生野菜を次亜水で除菌したあとに更にスチコンで加熱除菌をして提供をしていますか?
徹底した衛生管理の下で給食業務を行うことは当然のことですが、スタッフを疲弊させてまでも上記の内容を行う必要があるのでしょうか? 私は理解ができません。
皆さんのご意見をお聞きしたいです。よろしくお願いします。