新卒 管理栄養士 給料について

こんにちは。
今年の4月から委託給食会社にて
病院で勤務している者です。

入社して2回目のお給料を頂きましたが
4月と5月では労働時間が約10時間ほど違うにも関わらず、お給料は1000円しか差がありませんでした。

月給制になるとこういうものなのでしょうか？
5月は4月よりも9時間を過ぎる労働ばかりでしたので、少しお給料を期待していたのですが。。あれだけ頑張ったのに1000円しか変わらないの？と少しショックでした（笑）

恐らく、変形労働制？が使われているのだと思いますが どこの会社でもこれは普通なのでしょうか？

教えて頂けると幸いです。
よろしくお願い致します。